Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms