Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RaraP11416 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RaraP11416 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RaraP11416 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RaraP11416 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RaraP11416 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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