Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms