Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClppO88696 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClppO88696 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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