Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms