Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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