Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms