Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarce1O54941 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms