Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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