Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitpnm1O35954 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitpnm1O35954 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitpnm1O35954 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm1O35954 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms