Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Sp100O35892 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sp100O35892 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms