Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms