Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcns1O35173 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcns1O35173 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms