Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LhbO09108 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LhbO09108 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LhbO09108 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LhbO09108 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms