Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms