Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3278L7N2D2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3278L7N2D2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3278L7N2D2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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