Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm6871L7N248 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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