Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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