Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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