Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms