Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms