Protein–RNA interactions for Protein: F6WY25

Gm10271, Predicted gene 10271, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10271F6WY25 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10271F6WY25 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms