Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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