Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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