Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms