Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf212F6TQD1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf212F6TQD1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf212F6TQD1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf212F6TQD1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnf212F6TQD1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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