Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms