Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms