Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms