Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rd3lB2RV38 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms