Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms