Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms