Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms