Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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