Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms