Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms