Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ckap5A2AGT5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap5A2AGT5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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