Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms