Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pramef6A2A8M8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms