Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms