Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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