Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms