Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psma4Q9R1P0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms