Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkab1Q9R078 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkab1Q9R078 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms