Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Col4a4Q9QZR9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Col4a4Q9QZR9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Col4a4Q9QZR9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Col4a4Q9QZR9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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