Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms