Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms