Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms