Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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