Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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